그룹당 여러 변수 집계 / 요약 (예 : 합계, 평균)
데이터 프레임으로부터, (응집하기 쉬운 방법이 sum
, mean
, max
동시에 외 c) 여러 변수?
다음은 일부 샘플 데이터입니다.
library(lubridate)
days = 365*2
date = seq(as.Date("2000-01-01"), length = days, by = "day")
year = year(date)
month = month(date)
x1 = cumsum(rnorm(days, 0.05))
x2 = cumsum(rnorm(days, 0.05))
df1 = data.frame(date, year, month, x1, x2)
연도 및 월별로 데이터 프레임 의 x1
및 x2
변수 를 동시에 집계하고 싶습니다 df2
. 다음 코드는 x1
변수를 집계 하지만 동시에 x2
변수를 집계 할 수도 있습니까?
### aggregate variables by year month
df2=aggregate(x1 ~ year+month, data=df1, sum, na.rm=TRUE)
head(df2)
어떤 제안이라도 대단히 감사하겠습니다.
이 year()
기능은 어디 에서 왔습니까?
reshape2
이 작업에 패키지를 사용할 수도 있습니다 .
require(reshape2)
df_melt <- melt(df1, id = c("date", "year", "month"))
dcast(df_melt, year + month ~ variable, sum)
# year month x1 x2
1 2000 1 -80.83405 -224.9540159
2 2000 2 -223.76331 -288.2418017
3 2000 3 -188.83930 -481.5601913
4 2000 4 -197.47797 -473.7137420
5 2000 5 -259.07928 -372.4563522
예,에 formula
, 당신은 할 수 있습니다 cbind
숫자 변수는 집계하기 :
aggregate(cbind(x1, x2) ~ year + month, data = df1, sum, na.rm = TRUE)
year month x1 x2
1 2000 1 7.862002 -7.469298
2 2001 1 276.758209 474.384252
3 2000 2 13.122369 -128.122613
...
23 2000 12 63.436507 449.794454
24 2001 12 999.472226 922.726589
참조 ?aggregate
의 formula
인수와 예.
data.table
빠른 패키지 사용 (더 큰 데이터 세트에 유용)
https://github.com/Rdatatable/data.table/wiki
library(data.table)
df2 <- setDT(df1)[, lapply(.SD, sum), by=.(year, month), .SDcols=c("x1","x2")]
setDF(df2) # convert back to dataframe
plyr 패키지 사용
require(plyr)
df2 <- ddply(df1, c("year", "month"), function(x) colSums(x[c("x1", "x2")]))
Hmisc 패키지에서 summary () 사용 (열 제목은 내 예제에서는 지저분합니다)
# need to detach plyr because plyr and Hmisc both have a summarize()
detach(package:plyr)
require(Hmisc)
df2 <- with(df1, summarize( cbind(x1, x2), by=llist(year, month), FUN=colSums))
으로 dplyr
패키지, 당신이 사용할 수있는 summarise_all
, summarise_at
또는 summarise_if
동시에 여러 변수를 집계하는 기능. 예제 데이터 세트의 경우 다음과 같이 수행 할 수 있습니다.
library(dplyr)
# summarising all non-grouping variables
df2 <- df1 %>% group_by(year, month) %>% summarise_all(sum)
# summarising a specific set of non-grouping variables
df2 <- df1 %>% group_by(year, month) %>% summarise_at(vars(x1, x2), sum)
df2 <- df1 %>% group_by(year, month) %>% summarise_at(vars(-date), sum)
# summarising a specific set of non-grouping variables using select_helpers
# see ?select_helpers for more options
df2 <- df1 %>% group_by(year, month) %>% summarise_at(vars(starts_with('x')), sum)
df2 <- df1 %>% group_by(year, month) %>% summarise_at(vars(matches('.*[0-9]')), sum)
# summarising a specific set of non-grouping variables based on condition (class)
df2 <- df1 %>% group_by(year, month) %>% summarise_if(is.numeric, sum)
후자의 두 가지 옵션의 결과 :
year month x1 x2
<dbl> <dbl> <dbl> <dbl>
1 2000 1 -73.58134 -92.78595
2 2000 2 -57.81334 -152.36983
3 2000 3 122.68758 153.55243
4 2000 4 450.24980 285.56374
5 2000 5 678.37867 384.42888
6 2000 6 792.68696 530.28694
7 2000 7 908.58795 452.31222
8 2000 8 710.69928 719.35225
9 2000 9 725.06079 914.93687
10 2000 10 770.60304 863.39337
# ... with 14 more rows
참고 : summarise_each
찬성되지 않으며 summarise_all
, summarise_at
하고 summarise_if
.
위의 주석 에서 언급했듯이 -package 에서 recast
함수를 사용할 수도 있습니다 reshape2
.
library(reshape2)
recast(df1, year + month ~ variable, sum, id.var = c("date", "year", "month"))
동일한 결과를 얻을 수 있습니다.
Interestingly, base R aggregate
's data.frame
method is not showcased here, above the formula interface is used, so for completeness:
aggregate(
x = df1[c("x1", "x2")],
by = df1[c("year", "month")],
FUN = sum, na.rm = TRUE
)
More generic use of aggregate's data.frame method:
Since we are providing a
data.frame
asx
and- a
list
(data.frame
is also alist
) asby
, this is very useful if we need to use it in a dynamic manner, e.g. using other columns to be aggregated and to aggregate by is very simple - also with custom-made aggregation functions
For example like so:
colsToAggregate <- c("x1")
aggregateBy <- c("year", "month")
dummyaggfun <- function(v, na.rm = TRUE) {
c(sum = sum(v, na.rm = na.rm), mean = mean(v, na.rm = na.rm))
}
aggregate(df1[colsToAggregate], by = df1[aggregateBy], FUN = dummyaggfun)
Late to the party, but recently found another way to get the summary statistics.
library(psych) describe(data)
Will output: mean, min, max, standard deviation, n, standard error, kurtosis, skewness, median, and range for each variable.
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